巢湖市地方税务局成立于1994年，2000年初巢湖撤市改区后，更名为居巢区地税局，2011年8月，随巢湖区划调整，县级巢湖市地税局挂牌成立。

目前，党组班子成员10人，局长1人，副局长7人，党组成员兼分局长1人，纪检组长1人；现有正式在职人员139人，协税人员59人，平均年龄44岁；在职人员全部获得大专以上学历，其中研究生学历6人，本科学历108人；70人取得初级以上职称，注册税务师6人，注册会计师2人。

巢湖市地方税务局机关共设14个科室；下辖1个稽查局、10个征收管理分局、1个社保费征集办公室、1个“两税”（契税和耕地占用税）征集中心。

2012年，巢湖市地税局承担全省税源专业化管理试点任务，在机构设置上进行了相应调整，10个征收管理分局分别为：一是纳税服务局，主要是负责城区涉税事项办理；二是风险评估局，主要职责是进行纳税评估。三是重点税源管理局，集中统一管理全市年纳税50万元以上的重点税源户；四是行业税源管理局，负责全市房地产开发、建筑安装、交通运输等行业的税源管理；五是税源管理一局，负责卧牛山、天河街道办事处区域内的一般税源管理；六是税源管理二局，负责亚父、凤凰山办事处区域内的一般税源管理；七是税源管理三局，负责柘皋镇、夏阁镇、苏湾镇、栏杆集镇和庙岗乡区域内的一般税源管理；八是税源管理四局，负责黄麓镇、中庙办事处区域内的一般税源管理；九是税源管理五局，负责中垾镇、烔炀镇区域内的一般税源管理；十是税源管理六局，负责槐林镇、坝镇、银屏镇、散兵镇区域内的一般税源管理。

截至2016年8月31日，全市辖区内共有税务登记户21716户。2016年上半年累计组织地方税费收入138691万元，其中巢湖市征收121590万元，增长14.06%，完成政府下达年度计划的62.08%。

自1995年起，按省政府要求，巢湖市地方税务局还负责全市10项基金（费）的征集工作（五项社保费包括：养老、失业、医疗、工伤、生育这五个险种；其他基金费分别为：地方教育附加、水利建设基金、文化事业建设费、残疾人就业保障金、工会经费）。

巢湖市地方税务局相继被评为：安徽省第六、七、八、九、十届“文明单位”，“人民满意的公务员集体”；安徽省地税系统“先进集体”、“安徽省卫生先进单位”；连年被巢湖市委、市政府评为“先进集体”；连续10年被巢湖市评为“政风评议满意单位”；连年被市纪委评为“党风廉政和反腐败工作先进集体”。